Het gemeentewapen van Den Dungen met daarop de patroonheilige Jacobus de Meerdere is geheel terug te vinden op de gemeentevlag van Den Dungen. De rest van de vlag geeft weer de rood-witte vlakken. Hiermee wordt aangegeven dat Den Dungen hoort bij de provincie Noord-Brabant, waarvan de vlag bestaat uit 24 rood-witte vakken.
De gemeentevlag van Den Dungen werd wegens opheffing en herindeling tot 1996 gebruikt. Hierna hanteert men de gemeentevlag van Sint Michielsgestel.