Deze kerk is gebouwd in 1957 als Gereformeerde Kerk, met de naam Woestduinkerk. De architecten waren A. Meijer en T.H.van der Zee. Na de verbouwing in 1995 in het kader van SOW heet deze kerk Jacobuskapel.
In het kader van toenemende samenwerking met De Ark in Amsterdam-Slotervaart, alsmede de continue afname van kerkgangers is in 2009 besloten, dat De Ark als kerk voor beide PKN gemeenten in gebruik zal blijven en dat de Jacobuskapel, na een opknapbeurt van De Ark, op termijn als kerk zal worden gesloten. Dat wordt een feit per eind september 2010.
Het is niet geheel duidelijk naar welke Jacobus de kapel genoemd is, maar uit de aanwezigheid van een icoon met een heilige en een aantal schelpen, is het waarschijnlijk Jacobus de Meerdere.